Alonso, vainqueur de la Coupe du monde en 2010, a remporté son premier rôle d'entraîneur avec l'équipe des moins de 14 ans du Real Madrid en 2018.
Après avoir impressionné en trois ans en charge de l'équipe B de Real Sociedad, son premier rôle de gestion dans le football en première équipe est survenu lorsqu'il a pris le relais à Bayer Leverkusen en octobre 2022.
Il a levé le club du deuxième du bas à une sixième place dans la Bundesliga 2022-23, avant la saison suivante, la saison suivante a obtenu le premier titre allemand du club et devenant le premier côté à remporter la compétition avec un record invaincu.
Une défaite finale de la Ligue Europa par Atalanta a représenté sa seule défaite en 53 matchs dans toutes les compétitions, avant de terminer un double national en Coupe allemande.
Alonso, un double vainqueur du championnat d'Europe auprès de l'Espagne, était lié à Real, Liverpool, où il a remporté la Ligue des champions en 2005, et le Bayern l'année dernière, mais a déclaré en mars 2024 qu'il voulait rester à Leverkusen après les discussions avec la hiérarchie du club.
Malgré la perte de trois fois en Bundesliga cette saison, Leverkusen n'a pas pu défendre son titre.
L'équipe d'Alonso a été éliminée de la Ligue des champions de cette saison dans les 16 derniers temps par le Bayer Munich, alors qu'ils ont subi une défaite de choc contre Arminia Bielefeld de troisième niveau en demi-finale de la Coupe allemande.
